微藻是含有叶绿素，能进行光合作用，自养无根、茎、叶分化的低等植物；微藻形态微小、结构简单，显微镜下观察有单细胞、多细胞、群体或丝状等；微藻生长速度快，在水中、土壤、空气中都有藻的存在。
1. 藻的分类
绿藻—小球藻、栅列藻、卵囊藻、纤维藻、水棉、刚毛藻、双星藻、团藻等；
硅藻—小环藻、针杆藻、菱形藻、羽纹硅藻、角毛藻、骨条藻等；
蓝藻—微囊藻、鱼腥藻、蓝纤维藻、颤藻、席藻、螺旋藻等；
裸藻—绿裸藻、壳裸藻、血红裸藻、梭裸藻等；
甲藻—裸甲藻、光甲藻、角甲藻等；
黄藻—黄丝藻等；
隐藻—隐藻、蓝隐藻等；
金藻—小三毛金藻、单鞭金藻、双鞭金藻、黄群藻等；红藻、褐藻、轮藻
2. 藻的作用
藻作为初级生产者，能为养殖池塘提供氧气和营养物质。进行科学有效的藻类管理可稳定池塘水质指标，藻类通过源源不断地提供溶解氧，促进氨氮、亚硝酸盐的转化，从而保证养殖池塘内的氨氮、亚硝酸盐及pH的持续稳定。
藻类具有多种生物质，如藻多糖，CGF生长因子等，能够有效提高养殖动物的免疫能力，增强养殖动物抗病能力，改善养殖动物品质。此外藻类可作为生物肥，藻类老化死亡后在微生物作用下可以转化为生物肥料，有助于保持水体肥力，减少有害物质的产生。
3. 常见有益藻
3.1 绿藻类
3.1.1 小球藻：单细胞或多细胞聚集，细胞大小不一；细胞呈球形或椭圆形，直径为2~12 μm；具1个杯状或片状的色素体。有1个或无蛋白核。小球藻营养价值丰富（蛋白质、脂类、CGF生长因子等），既可作为饵料，又可用作调水，提高池塘溶解氧，降解转化有害物质，稳定池塘指标，控制有害藻。
3.1.2 栅列藻：由2个、4个、8个、16个或32个细胞组成群体，常见为4个或8个；细胞椭圆形、卵形、新月形或纺锤形等；具一个色素体，周生，具一个蛋白核。
3.1.3 卵囊藻：常由2、4、8或16个细胞组成；包被在部分胶化膨大的母细胞内；色素体多1~5个，片状、多角形或不规则盘状，周生，每个色素体具1个蛋白核或无。
3.1.4 鼓藻：单细胞，侧扁，中部环状凹入称为缢缝，缢缝把1个细胞分为2个对称的半细胞；每个半细胞具1、2或4个轴生色素体，每个色素体具1个或多个蛋白核，少数种类具6~8条带状色素体，每条色素体具多个蛋白核。
3.2 硅藻类
3.2.1小环藻：细胞呈圆盘形，壳面具点纹、线纹或肋纹，分为外围和中央区；具多数小盘状色素体。有的也通过壳面相连成链状群体；小环藻有两个面，一个壳面呈圆形，上面有点纹、线纹或肋纹，一个带面为方形；小环藻细胞壁是硅质，比重大经常下沉，在取样的时候一般在池塘中下层。
3.2.2 舟形藻：单细胞，少数群居于自己分泌的胶质管内；细胞舟形至椭圆形，中部宽两端尖。壳面两侧对称，末端钝圆；具有2-4个板状或带状色素体。
3.2.3 针杆藻：细胞单独生活，或簇生成射出状或扇状体。大多数种类生长在淡水，少数是沿海底部生长的。细胞细长，附着在其他植物或其他物体上。壳面针形，无壳缝，只有拟壳缝，尚保留着拟中节和拟端节。色素体少。复大孢子每个细胞有两个，非接合而成。细胞长线形，浮游种类为单细胞或为放射状群体。
3.2.4 菱形藻：细胞纵长，梭形、舟形、菱形等，细胞两端尖形，钝尖；细胞壳面和带面不成直角，因此横断面呈菱形；具有2个带状侧生色素体，上下位。
4. 藻相管理
池塘水体中藻类群落结构组成各不相同，藻类种间也存在生态竞争与演替，当某种环境因子出现变化且未及时干预就会引起藻相的改变。要使池塘藻相良好稳定，首先需要水体中有益藻的存在。对于无藻水体，要向池塘补充有益藻种，如小球藻，硅藻。有虫的池塘可通过物理灯光诱捕控虫，然后大量补充藻种；如前期使用化学药物导致藻种缺乏可先用藻平衡素做铺垫然后再补充藻种。而对于有藻水体最好先取样镜检，若以有益藻为主，可直接下定向肥；若有害藻较多，则要先进行控制再补充有益藻。通过藻、肥、菌之间的平衡进行控制，使生态系统各环节之间相对平衡。
4.1 藻种的选择
对于藻种的选择则需要综合考虑养殖品种、藻种特性及环境条件等因素，有针对性的进行选择。常见养殖品种包括普通鱼类、中下层鱼、虾蟹、海参蛏子贝类等。水产常用有益藻包括硅藻，多为底栖藻类，特殊的孔纹结构，有吸附能力，硅藻水透明度高；硅藻广温4℃以上，广盐，捕光能力强，阴天下雨也可以用；低温小球藻4℃就可扩培应用；高温小球藻38℃也可繁殖；营养价值高，可作为饵料。
4.2 肥料的选择
建议使用定向绿藻肥和定向硅藻肥定向培养硅绿藻水，不建议使用有机肥，有机肥容易使有害藻大量繁殖破坏水质且耗氧严重。也不建议单一补充过多氮肥、磷肥，藻类所需碳氮氧元素比例为106:16:1，某种元素投入过多也会影响藻类生长。由于现在水体容易富营养化，一般需要补充碳元素，但是需要根据池塘具体情况具体分析。
4.3 藻相平衡
4.3.1 前期清塘解毒后，主要是在池塘中洒下藻种+肥料，使有益藻占优势；
4.3.2 根据温度、天气及藻类不同，到达高峰时间也略有不同（25℃以上5-8天），藻的活性和接种密度不同，要根据实际情况调整藻种及肥料用量；
4.3.3 维持藻、肥、菌平衡稳定；
4.3.4 防止倒藻泛塘。